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DNA序列

题意

  • 就是让你找这样一个字符串,让所给的串是目标串的子串,那么目标串最短应该是多少 (最多8个串,每个串长度最大为5)

    分析

  1. 这个题我只用了迭代加深搜索,但是没剪枝过了,数据没卡我(AAAA GGGG CCCCC TTTTT就T了)。后面想了一下状态压缩记忆化搜索是可以在有限时间搜索出来的。用8个六进制的数字表示每一个串的当前位置。然后这个状态只有四种转移方向ATGC,然后从最终状态往前记忆化搜索就好了。

  2. 搜索一直没想出来怎么剪枝…,所以就使用迭代加深思想,然后暴力的枚举8个队列串首字符,比如枚举当前字符为A,那么谁队首是A的就POP出来,如果没有队首是A那就没必要搜索了。

思考

  1. 没啥坑点,就是不好好剪枝你会T在上面那个样例

  2. 在用状态压缩转移的时候,要用记忆化从最后搜,因为最初状态往后转移的话,初状态不好枚举。

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/*************************************************************************
> File Name: hh.cpp
> Author: liangxianfeng
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> Created Time: 2016年05月10日 星期二 09时27分41秒
************************************************************************/

#include<iostream>
#include<cstdio>
#include<cstdlib>
#include<cstring>
#include<algorithm>
#include<stack>
#include<map>
#include<set>
#include<vector>
#include<queue>
#include<string>
#include<cmath>
using namespace std;
#define ll long long
#define rep(i,n) for(int i =0; i < n; ++i)
#define CLR(x) memset(x,0,sizeof x)
#define MEM(a,b) memset(a,b,sizeof a)
#define pr(x) cout << #x << " = " << x << " ";
#define prln(x) cout << #x << " = " << x << endl;
const int maxn = 4e5+100;
const int INF = 0x3f3f3f3f;
int len[10];
int pos[10];
char ch[5] = "ATGC";
char s[10][10];
int maxdepth, n;
bool dfs(int depth, int *pp) {
if(depth > maxdepth) return false;
int p[9];
int sum = 0;
for(int i = 0; i < n; ++i) p[i] = pp[i], sum+=len[i]-pp[i];
if(sum==0) return true;
for(int i = 0; i < 4; ++i){
sum = 0;
for(int j = 0; j < n; ++j){
p[j] = pp[j];
while(p[j] < len[j] && s[j][p[j]] == ch[i])
{
p[j]++,sum++;break;
}
}
if(sum) if(dfs(depth+1, p)){
return true;
}
}
return false;
}
int main(){
#ifdef LOCAL
freopen("/home/zeroxf/桌面/in.txt","r",stdin);
//freopen("/home/zeroxf/桌面/out.txt","w",stdout);
#endif
int t;
scanf("%d", &t);
while(t--){
scanf("%d", &n);
maxdepth = 1;
for(int i = 0; i < n; ++i){
scanf("%s", s[i]);
len[i] = strlen(s[i]);
if(len[i] > maxdepth) maxdepth = len[i];
}
for(; ; maxdepth++){
for(int i = 0; i < n; ++i) pos[i] = 0;
if(dfs(0,pos)) break;
}
printf("%d\n", maxdepth);
}
return 0;
}